消费者通过聚合支付发起订单之后，由聚合支付平台发送订单信息给收单机构进行交易确认(聚合收单机构就是拥有支付牌照的第三方支付公司，如微信、支付宝，随行付、拉卡拉等)然后清算机构(网联和银联)进行收款和资金清算，在第三方支付公司备付金中扣除相应费用再结算给商户
现阶段，个人码转为商户码，主要有两条途径：一是通过支付宝和微信等第三方支付方引导商户由个人码转变为商户码，两家均已在推进这一进程；二是将现有收款码转为收单机构提供的聚合支付方式。
目前市场上的收款码主要包括支付宝、微信等支付机构提供的“个人码”，支付宝、微信等支付机构提供的“商户码”;第三方支付机构、第四方支付提供的“聚合商户码”。聚合商户码聚合收款码集成了微信、支付宝、花呗、信用卡、云闪付、翼支付等多种支付方式，为商家提供统一管理后台，更方便快捷做帐，对于商家来说，0手续费秒到自己银行卡上，还更方便了客户支付有效的，效率的，方便的，不用扎堆，符合当地支付需求的收款方式。
聚合收单更加方便。这里所谓的聚合收单，是指将各种发卡侧的交易聚合在一个系统中进行清结算，商户体验更加。举个简单的例子，支付宝的收款码只能用支付宝钱包进行支付，微信也是如此。如果商户想实现两个收款渠道，那就得帖两个二维码，并且在对账时，要分别登陆支付宝和微信的管理平台进行查看，并加总得出最终的结果。但如果使用第三方支付机构提供的聚合收单二维码，无论是支付宝、微信支付、银联扫码抑或是其他支付方式，这个二维码都能识别并支付成功，商户也可以在后台查看每一笔交易和对应的支付渠道。这对于商户来说便捷性大大提升了。当然，银行现在都能做聚合收单，所以第三方支付机构在这块的优势也并不明显。